WebOct 11, 2024 · ChIP-seq数据分析课程学习笔记之peaks的可视化. 其中 中国医科大的“小高” 同学给大家带来的就是ChIP-seq数据分析实战视频课程的配套笔记,希望可以帮助大家更好的吸收消化课程内容!. 首先视频免费共享在B站:【生信技能树】Chip-seq测序数据分析ChIP-SEQ实战 ... WebSep 21, 2024 · 把上面的代码保存为脚本runMotif.sh,然后运行:nohup bash runMotif.sh 1>motif.log & 不仅仅找了motif,还顺便把peaks注释了一下。得到的后缀为peakAnn.xls 的文件就可以看到和使用R包注释的结果是差不多的。 还可以使用meme来找motif,需要通过bed格式的peaks的坐标来获取fasta ...
一文读懂 ChIPseq - 简书
WebChIP-seq是将染色质免疫沉淀技术(ChIP)与新一代测序技术(NGS)相结合[1] ... 而我们通过ChIP-seq,对 Peak 区域鉴定 motif 序列,在序列片段的每个位置上,得到不同碱基的数量,形成一个矩阵,将得到的 motif 序列与 JASPAR 数据库进行比对,根据碱基数量权 … WebChIP-Seq分析和作用. 1:ChIP-Seq数据是基因组特异性富集的序列的测序结果,包括组蛋白修饰ChIP-Seq (H3K4me3/启动子相关/narrowpeak、H3K4me1/增强子相关/narrowpeak、H3K27ac/增强子相关/broadpeak) … desk backgrounds with blue images
什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究? - 知乎
Web利用ChIP-seq技术可得到核小体定位图谱,核小体定位在转录调控,DNA复制和修复等多种细胞过程中其中重要作用; 利用ChIP-seq技术可研究DNA甲基化情况,DNA甲基化能引 … http://www.bio-info-trainee.com/1770.html Web关于ChIp-seq:. 指的是结合位点分析法,作为研究体内蛋白质与DNA相互作用。. 染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的 … chuckles custom ag